Někdy jsou na světě zázraky, které je obtížné vysvětlit z hlediska vědy, a objevují se verze o zásahu určité entity, která se v náboženství nazývá Bůh, Stvořitel, a dalších mocných entit. Vědci se dlouho pokoušejí vysvětlit tajemství Svatého ohně a věří, že to může být jeden z největších podvodů lidstva. Skeptici často používají různé metody k vyloučení možnosti božského a mystického v našem světě.
Existuje několik verzí původu Svatého ohně, mezi nimi existuje teorie mimozemského původu a verze chemických procesů, které mnoho lidí nemusí pochopit a uvěřit v božský zázrak. Ministři různých náboženství často neumožňují vědcům zkoumat různé svatyně a artefakty, ale někdy se to stává. Například v roce 2008 se ruskému fyzikovi Andrejovi Volkovovi podařilo přiblížit tajemství Svatého ohně, ale jeho výzkum lze jen stěží nazvat argumenty ve prospěch vědy, a to napsal:
Přes podivný incident s Volkovem opravdu nevěřím v božský původ tohoto zázraku. Zdá se mi, že se jedná o náboženský podvod, aby lidé přesvědčili velké množství lidí o existenci a moci Boží. Pracovníci církve často dělají takové kroky, ale často brání vědcům zkoumat takové zázraky.