Bakteriofágy obsahující Tailless nemohly být detekovány standardními metodami - ale nyní vědci věří, že dominují světovým oceánům.
Každá kapka vody, která není příliš hluboká od hladiny moře, obsahuje asi 10 milionů virů. Není divu, že biologové neustále objevují nové, ačkoli objev celé nové skupiny je stále velmi vzácný. Zdá se, že standardní techniky jednoduše neumožnily, aby byly pozorovány, ačkoli se tyto viry ukázaly být extrémně početné - možná jsou rozšířené nejen v oceánu a jednoduše unikly vědcům.
Martin Polz z Massachusetts Institute of Technology a jeho kolegové zkoumali vzorky vody odebrané na severoamerickém pobřeží Atlantického oceánu. Hledali viry obsahující dvouvláknovou DNA - takové viry jsou velmi rozšířené, včetně herpesu a bakteriofága T4 (Caudovirales), který je známý všem ze školy. Napadení kultur mořských bakterií Vibrionaceae vědci objevili 200 různých DNA virů, z nichž 18 bylo přičítáno novému řádu Autolykiviridae. O tom píšou v článku publikovaném v časopise Nature.
Jméno skupiny odkazuje na hrdinu řecké mytologie Autolycus, mazaného zloděje, kterého je stejně těžké chytit jako tyto viry. "Nejběžnější viry na Zemi jsou bakterie infikující viry obsahující dvouvláknovou DNA," napsal Poltz a jeho spoluautoři. „Caudovirales s viry ocasu, které dominují v databázích a sbírkách plodin, však nepředstavují jejich přítomnost v životním prostředí. Ve skutečnosti ve vzorcích vody dominují viry tailless. “
Bakteriální buňky infikované Autolykiviridae / MIT Phages, Kauffman et al., 2018.
"Tailless" bakteriofágy Autolykiviridae se vyznačují malou velikostí genomu - pouze asi 10 000 bází, 4-5krát méně než u "sledovaných" příbuzných. Jejich schopnost infikovat a zabíjet bakteriální buňky byla také neobvyklá. Pokud obyčejné fágy v experimentech zpravidla postihly jeden konkrétní druh vibrací, infikovaly se v průměru čtyři a vedly k výrazně vyšší buněčné smrti. „Bylo zjištěno, že jsou zodpovědné za 40 procent bakteriálních úmrtí, ačkoli představovaly asi 10 procent z celkového počtu virů ve vzorku,“vysvětluje jeden z autorů práce.
Vibrační bakterie různých druhů jsou rozmístěny po obvodu diagramu, s nimi jsou spojeny kruhy virů, které je infikují: modrá - „ocasní" bakteriofágy, oranžová - „ocasní" Autolykiviridae / MIT, Kauffman et al., 2018.
Tato čísla ukazují na velkou roli, kterou nová skupina Autolykiviridae hraje v regulaci bakteriálních populací a v biosféře jako celku. Vědci věří, že jejich technika pomůže najít viry, které dříve unikly detekci v půdě a možná v lidském střevě. Podobné genetické sekvence se skutečně nacházejí v genomech bakterií v lidské mikroflóře.
Propagační video:
Sergey Vasiliev