Vědci objevili nový virus v Brazílii, jehož DNA je 90 procent genů neznámých vědě. Výsledky tohoto objevu jsou zveřejněny na stránce předtisku bioRxiv.
Virus byl detekován v umělém jezeře Pampulha v brazilském městě Belo Horizonte. Její nepříliš složitý genom sestává téměř výhradně z genů neznámých vědě. Autoři pojmenovali nový virus Yaravirus brasiliensis po vodní víly Yara z mytologie národů Jižní Ameriky.
Vědci spekulují, že čelí prvnímu případu neznámé izolované skupiny virů nebo vzdáleného druhu obřího viru, který se vyvinul do menší formy.
Obrovské viry, objevené teprve ve 21. století, dosahují velikostí srovnatelných s velikostí bakteriální buňky. Svůj název získali díky svým velkým kapsidům - proteinovým membránám, které zapouzdřují viriony - virovým částicím. Mají také DNA odpovídající délky, která přesahuje 200 tisíc párů bází a často obsahuje tzv. Osiřelé geny (ORFan), které se nenacházejí v žádné jiné skupině organismů.
Komplexní genomy umožňují obřím virům syntetizovat proteiny, a proto provádět opravu, replikaci, transkripci a translaci DNA. Před jejich objevem se věřilo, že viry takové schopnosti nemají, protože jsou to inertní tvorové, kteří mohou infikovat pouze jejich hostitele. Všechny známé obří viry jsou parazity améby.
A i když je velikost nového mikroorganismu výrazně menší než velikost obrovských virů - asi 80 nanometrů - parazituje také na amébách a jeho genom je téměř úplně osiřelý: 68 jeho genů (více než 90 procent) nenalezlo analogy v žádném známém organismu a pouze šest nejasně podobné těm, které jsou známé vědě.
"Je to proto, že virus je novou rodokmenem amébického viru s úžasným původem a fylogenií," uvedl v tiskové zprávě jeden z vedoucí studie, Jônatas Abrahão z Federální univerzity v Minas Gerais v Brazílii.
Vědci analyzovali více než osm a půl tisíce metagenomů, ale nenašli mezi nimi viry související s novými mikroorganismy. Stejně jako ostatní viry této skupiny je představována dvouvláknovou DNA, jejíž délka je 44 900 párů bází a obsahuje 74 kódujících fragmentů.
Propagační video:
"Při použití standardních protokolů naše první genetická analýza nezjistila žádné rozpoznatelné sekvence kapsidů nebo jiné klasické virové geny v yaraviru," vysvětluje Yonatas Abrajao a vedoucí druhé studie Bernard La Scola z Aix-Marseille University v Francie.
Podle oficiálních metagenomických protokolů nemůže být yaravirus uznán jako virový agens, protože s nimi nemá jasnou podobnost. Vědci zatím nemohou říct, co to vlastně je - zástupce zcela nové skupiny nebo potomek obřího viru, který se nějakým způsobem vyvinul do menší podoby.
"Počet neznámých proteinů, které tvoří částice yaraviru, odráží variabilitu, která existuje ve virovém světě, a kolik nových virových genomů musí být dosud objeveno," uzavírají autoři.
