Vědci objevili v genomu prasat rodinu jedinečných krátkých opakování, která mají evoluční podobnost s podobnými opakováními u primátů.
Na projektu se podíleli vědci z Jilin University (Changchun, Čína) a Akademie zemědělských věd (Heilongjiang, Čína) ve spolupráci s Firefly BioWorks Corporation (USA).
Po analýze struktury a původu PRE-1 (prasečí opakující se prvek, doslovně - „prasečí opakující se prvek“) dospěli k závěru, že nejbližší příbuzní primátů na bývalé superkontinentní Laurasii mohou být prasata. Předtisk výzkumu byl publikován na serveru bioRxiv 31. srpna 2015.
Studovaná CDP (krátká dispergovaná repetice) PRE-1 se nachází v intergenní oblasti, přibližně 686 ~ 985 párů bází před začátkem genu kódujícího protein vázající protein na růstový faktor (IGFBP7). Opakovaná sekvence PRE-1 299 párů bází byla porovnána s 40 různými opakováními Alu primátů a významné podobnosti byly nalezeny jak v samotných sekvencích, tak ve vzoru distribuce jejich repetic po chromozomech.
Predikovaná sekundární struktura RNA opakuje PRE-1 složená do modelu podobného Alu-opakuje. Nakonec společný původ PRE-1 a Alu z takzvané 7SL RNA (RNA rozpoznávající signál) naznačoval jejich evoluční podobnost a přisuzoval prasata rodině, která zahrnuje hlavně primáty.
Dříve se vědci při stavbě fylogenetických stromů spoléhali pouze na podobnosti a rozdíly genů, přičemž ignorovali skutečnost, že v průběhu evoluce prošel celý genom změnami, včetně těch prvků, které nekódují proteiny nebo RNA a jejichž význam je pro vědce stále nejasný.
Propagační video:
Tato studie založená na integrovaném přístupu k analýze intergenních prvků poskytuje podle autorů „velmi přesvědčivá“fakta, z nichž lze vyvodit evoluční závěry. Podle těchto výsledků se zejména odhadovaná doba divergence druhů posune z doby před 65 až 80–100 miliony let.